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Ribosomal Dysfunction in AL Amyloidosis: Gene Expression Profile Meta-Analysis
免疫球蛋白轻链淀粉样变性中的核糖体功能障碍:基因表达谱的meta 分析

演讲者: Department of Haematooncology, University Hospital Ostrava and Faculty of Medicine OU, Ostrava, Czech Republic  Zuzana Kufova

免疫球蛋白轻链淀粉样变(ALA)是一种浆细胞恶病质,表现为在不同器官和组织中出现淀粉样纤维沉积,最终导致器官功能障碍。同其他单克隆免疫球蛋白病相比,目前尚无ALA基因组表达的系统性研究。本研究旨在揭示ALA患者与健康供体(ND)、意义未明的单克隆丙种球蛋白病(MGUS)、冒烟型骨髓瘤(SMM)及多发性骨髓瘤(MM)患者之间的基因表达差异。

研究者从GEO 数据库(GSE6477,GSE24128)中获得 ND (n=15)、MGUS (n=21)、SMM (n=24)、MM (n=69) 及ALA (n=16) 患者的基因表达数据。之后,应用基因芯片显著性分析(SAM)的方法对ALA基因特异表达进行分析,当基因倍数变化(FC)≥1.5或≤0.5且错误发现率(FDR)<0.001时,视为有统计学显著性。最终,应用 DAVID 生物信息学资源数据库6.7 (DAVID Bioinformatics Resources 6.7)获取差异表达基因的生物学意义。

通过比较ALA与ND,MGUS,SMM和MM 发现了256个特异基因。其中受影响最大的基因本体(GO)是“翻译延伸”(GO:0006414),其次是“内质网腔蛋白残留”(GO:0006621)。本体的“细胞组分”则获得“胞浆核糖体”(GO:0006621)的改变。分析表明,ALA的显著基因见图-1:属于40S核糖体亚单位的蛋白(RPS10、RPS14、RPS17、RPS6、RPS21、RPS25、RPS29、eIF3L、eIF3F及eIF4G2)募集并调控翻译的启动。本研究还显示,核糖体蛋白如L11、L23、L37、S14及S25与MDM2 结合,导致p53的稳定化及细胞周期阻滞。热休克蛋白90(Hsp90)的胞质(HSP90AB1)和内质网同系物(HSP90B1)是帮助其他蛋白正确折叠的分子伴侣蛋白。

研究推测ALA的进展除了能影响翻译启动和蛋白折叠,还与核糖体功能失调有关。核糖体功能失调或许能解释异常克隆是怎样产生“不幸蛋白(unlucky protein)”,从而逃过细胞凋亡的。如果这种功能失调是“不幸蛋白”合成的初始事件或次级反应的话,对此进行深入研究或许能回答上述问题。